Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
本作将讲述与“结”有关的都市传说。
拥有超强吐槽气质的高中生小雪芹，因自己的吐槽气质而最讨厌渴望被吐槽的人。然而，盯上他的却是外表、言行、气场、甚至其存在本身都充满槽点的最强中二高中生——花鸟兜。发誓绝对不吐槽他的芹，终究还是没有忍住。他的周围，有点奇怪的家伙们也开始渐渐聚集……时而爆笑时而可爱的男子高中生喜剧故事即将拉开序幕。
「……原来我，可以活着呀。」明明能力值为零，却被选进勇者小队的芙兰姆。唯一拥有的是种名为「翻转」的莫名能力。果不其然，虽在战斗中完全派不上用场，仍不气馁努力为小队奉献。然而队中一位赫赫有名的天才贤者吉恩却看她不顺眼，不只动不动就找碴，最后甚至硬是把她卖给了奴隶商人。在奴隶商会内受尽折磨的芙兰姆，某天为了娱乐目的，即将沦为怪物的大餐。没想到，当她举起号称一拿到手就会将身体融化的「诅咒大剑」瞬间——她的人生急遽翻转。
